Introduction à la bioinformatique

INFO-F-208

 

Syllabus et projets

Part 1: Background Basics

1. The Nucleic Acid World

2. Protein Structure

3. Dealing with Databases


Part 2: Sequence Alignments

4. Producing and Analyzing Sequence Alignments

5. Pairwise Sequence Alignment and Database Searching

6. Patterns, Profiles, and Multiple Alignments


Part 3: Evolutionary Processes

7. Recovering Evolutionary History

8. Building Phylogenetic Trees


Part 4: Genome Characteristics

9. Revealing Genome Features

10. Gene Detection and Genome Annotation


Part 5: Secondary Structures

11. Obtaining Secondary Structure from Sequence

12. Predicting Secondary Structures


Site web: http://www.garlandscience.com/textbooks/0815340249.asp

Marketa Zvelebil, Jeremy O. Baum. Understanding Bioinformatics August 2007   Paperback: 978-0-8153-4024-9

  1. Description dans le programme des cours ULB

  2. Objectifs

  3. Résumé

  4. Staff

  5. Info Pratiques

  6. Contenu

  7. Syllabus, projets et exemple d’examen, regardez UV

Résumé

Staff

Titulaire:

    Tom Lenaerts, Bureau 2O8.117, tél 02 650 60 04, email: tlenaert@ulb.ac.be


Assistants:

    Charlotte Nachtegael, Bureau 2N8.213, email: Charlotte.Nachtegael@ulb.ac.be 

Les diapos et les projets sont disponible sur Université Virtuelle de l’ULB


Prof. T. Lenaerts

2010-2020

Objectifs du cours

Étudier les méthodes informatiques qui étaient construites pour la résolution des question biologiques. Rendre les étudiants capables de comprendre les questions biologiques et les articles publiés sur ce sujet.  En outre, les étudiants devraient être capable d’expliquer et reproduire certaines algorithmes. L’objectif secondaire est d’augmenter l’intérêt des étudiants pour des sujets interdisciplinaires.

La matière renseignée se répartit sous 5 sujets principaux: (1) l’alignement des séquences par paires, (2) chercher des homologues dans des bases de données, (3) L’alignement de multiple séquences et la détections des motifs, (4) la construction des arbres phylogénétiques, et (5)  la prédiction de la structure secondaire.

Horaire

Cours Théorique Teams GRP_INFO_F208_202021

  1. Les Lundi de 10h00 à 12h00 (à partir de 21 Septembre 2020)


TP: Teams GRP_INFO_F208_202021

  1. Les vendredis de 10h à 12h

INFO Pratiques

Regardez Contenu du cours

Contenu