Introduction à la bioinformatique
INFO-F-208
Introduction à la bioinformatique
INFO-F-208
Syllabus et projets
Part 1: Background Basics
1. The Nucleic Acid World
2. Protein Structure
3. Dealing with Databases
Part 2: Sequence Alignments
4. Producing and Analyzing Sequence Alignments
5. Pairwise Sequence Alignment and Database Searching
6. Patterns, Profiles, and Multiple Alignments
Part 3: Evolutionary Processes
7. Recovering Evolutionary History
8. Building Phylogenetic Trees
Part 4: Genome Characteristics
9. Revealing Genome Features
10. Gene Detection and Genome Annotation
Part 5: Secondary Structures
11. Obtaining Secondary Structure from Sequence
12. Predicting Secondary Structures
Site web: http://www.garlandscience.com/textbooks/0815340249.asp
Marketa Zvelebil, Jeremy O. Baum. Understanding Bioinformatics August 2007 Paperback: 978-0-8153-4024-9
•Objectifs
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•Staff
•Info Pratiques
•Contenu
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Résumé
Staff
Titulaire:
Tom Lenaerts, Bureau 2O8.117, tél 02 650 60 04, email: tlenaert@ulb.ac.be
Assistants:
Charlotte Nachtegael, Bureau 2N8.213, email: Charlotte.Nachtegael@ulb.ac.be
Les diapos et les projets sont disponible sur Université Virtuelle de l’ULB
Prof. T. Lenaerts
2010-2020
Objectifs du cours
Étudier les méthodes informatiques qui étaient construites pour la résolution des question biologiques. Rendre les étudiants capables de comprendre les questions biologiques et les articles publiés sur ce sujet. En outre, les étudiants devraient être capable d’expliquer et reproduire certaines algorithmes. L’objectif secondaire est d’augmenter l’intérêt des étudiants pour des sujets interdisciplinaires.
La matière renseignée se répartit sous 5 sujets principaux: (1) l’alignement des séquences par paires, (2) chercher des homologues dans des bases de données, (3) L’alignement de multiple séquences et la détections des motifs, (4) la construction des arbres phylogénétiques, et (5) la prédiction de la structure secondaire.
Horaire
Cours Théorique Teams GRP_INFO_F208_202021
• Les Lundi de 10h00 à 12h00 (à partir de 21 Septembre 2020)
TP: Teams GRP_INFO_F208_202021
•Les vendredis de 10h à 12h
INFO Pratiques
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